История разворачивается вокруг молодого пилота по имени Хикару Ичидзё, чья жизнь переплетена с судьбами двух выдающихся женщин. Его возлюбленная, Миса Хаясе, является умной и решительной личностью, а начинающая певица Линн Минмэй мечтает покорить сердца слушателей своим голосом. На фоне бесконечной войны между человечеством и зентради, расой гигантов, обладающих флотом из миллионов кораблей, молодые герои сталкиваются с ужасами конфликта, который угрожает уничтожением всему живому на Земле. В этом безжалостном противостоянии зентради разделены на два враждебных лагеря: Мельтанди, женщины-гиганты, и их враги — мужчины. На фоне разрухи и хаоса, детская мечта и светлые чувства героев становятся источником надежды.
В условиях почти полного уничтожения планеты, где от прежней жизни осталась лишь прах, Хикару и Миса оказываются в опустошенном городе-крепости, известном как «Протокультуры». Именно здесь, среди развалин и тени прошлого, они пытаются найти пути к спасению не только своих жизней, но и оставшихся членов экипажа. Подрывные действия войны оставляют их на грани выживания, но, несмотря на это, внутренний свет и неугасимая решимость ведут их вперед. Они отправляют сигнал помощи на корабль «Макросс», осознавая, что только вместе они могут противостоять злу, угрожающему их миру. На этом фоне разворачивается эпопея о любви, преданности и мужестве, где каждая нота музыки становится символом надежды для человечества.