В 2029 году мир претерпел кардинальные изменения, связанные с развитием технологий в области кибернетики. Люди все чаще прибегают к возможности замены своих конечностей на роботизированные протезы, что открывает новые горизонты в медицине и повседневной жизни. Однако с такими достижениями возникают и новые проблемы, связанные с безопасностью и контролем. В этом технологически усовершенствованном обществе возникает угроза, связанная с высококлассными хакерами, которые способны манипулировать не только данными, но и человеческой природой. В центре этой истории оказывается майор Мотоко Кусанаги, опытный оперативник 9-го отдела службы безопасности, который принимает на себя ответственность исследовать случаи киберпреступлений.
Мотоко Кусанаги погружается в мир шифров и цифровых манипуляций, пытаясь раскрыть тайны, стоящие за действиями загадочного хакера, известного как Кукловод. Этот противник обладает невероятной способностью к управлению кибернетическими системами, что делает его крайне опасным соперником. В процессе расследования Кусанаги сталкивается с множеством вызовов, которые ставят под сомнение не только её физическую силу, но и глубинные аспекты идентичности и человечности. В поисках ответов майор осознаёт, что её собственные границы между человеком и машиной становятся все более размазанными. В конечном итоге, это расследование не только о поимке преступника, но и о поиске смысла в мире, где границы между физическим и виртуальным миром стираются с каждым днём.
