В сердце разрушенного Парижа разыгрывается напряжённая операция, в которой воздушный флот организации WILLE демонстрирует свою неукротимую стойкость. Беспилотные роботы, представляющие собой угрозу, становятся основными противниками, но опытные пилоты не сдаются. В их арсенале находится гигантский уплотнительный столб, который активируется для восстановления разрушенных участков города. Этот процесс не только помогает городу подняться с колен, но и обеспечивает критически важные ресурсы, такие как боеприпасы и запчасти к легендарным «Евангелионам». Все это происходит на фоне хаоса, в котором каждая секунда имеет значение, и команда WILLE демонстрирует невероятное мужество, борясь с невидимыми врагами.
Тем временем в Третьей деревне, восстановленном поселении, продолжается внутренняя драма, отражающая сильные чувства героев. Синдзи, потерявший надежду на жизнь после трагической утраты Каору, погружается в пустоту, отказываясь от своих прежних стремлений. Его состояние усугубляется пережитым горем и почти доведённым до конца Четвёртым ударом, что приводит к полной утрате смысла. Рэй, следуя за Асой, стремится поддержать его, но эмоции и история каждого из них переплетаются в сложный узор, отображая их внутреннюю борьбу. В этом новом мире, несмотря на разрушение и страдания, люди пытаются заново построить жизнь, стремясь к миру, который когда-то казался невозможным.